Scrutinul pentru referendumul constituţional din 5 septembrie nu a fost în totalitate liber şi corect. De această părere sunt experţii Coaliţiei Civice pentru Alegeri Libere şi Corecte, care au monitorizat referendumul. Reprezentanţii Coaliţiei au declarat luni, 13 septembrie, în cadrul unei conferinţe de presă la Agenţia „Info-Prim Neo”, că scrutinul din 5 septembrie a fost marcat de mai multe încălcări ale legislaţiei electorale, atât pe parcursul campaniei, cât şi în ziua referendumului. „Am atestat influenţă abuzivă şi intimidarea alegătorilor, afişaj şi agitaţie electorală nepermisă, cadouri electorale, dar şi declaraţii şi îndemnuri din partea unor administraţii publice locale de a boicota referendumul, contrar atribuţiilor care le revin”, a declarat secretarul Coaliţiei, Nicolae Panfil. Experţii Coaliţiei Civice pentru Alegeri Libere şi Corecte s-au declarat îngrijoraţi şi de procesul de întocmire a listelor electorale şi calitatea acestora. „Coaliţia este profund îngrijorată de faptul că în ziua referendumului nu a fost anunţat numărul total de alegători incluşi în listele electorale şi modalitatea prin care CEC a calculat rata de participare la referendum”, a mai spus Nicolae Panfil. Coaliţia consideră că CEC a admis derogări de la legislaţia electorală în vigoare când a înregistrat formaţiuni politice cu opţiunea sau intenţia de a boicota referendumul. „Formaţiunile politice, având la dispoziţie cele mai largi posibilităţi de a-şi mediatiza mesajele, în definitiv, au eşuat în intenţia de a informa adecvat cetăţenii”, a spus Nicolae Panfil. O altă deficienţă semnalată de Coaliţie este că autorităţile nu au asigurat pe deplin dreptul la vot al alegătorilor moldoveni din regiunea transnistreană, pentru că acolo au lipsit dezbaterile electorale, întâlnirile cu alegătorii şi afişajul electoral. Expertul „Promo-Lex”, Corneliu Cirimpei, a spus că de această dată rata de participare a alegătorilor din stânga Nistrului s-a redus cu mai mult de 80%. Aceştia nu au fost informaţi de către autorităţile Republicii Moldova cu privire la secţiile de votare la care sunt arondaţi. Coaliţia Civică pentru Alegeri Libere şi Corecte a atras atenţia autorităţilor, clasei politice, mass-media şi societăţii civile asupra necesităţii continuării eforturilor de asigurare a unor alegeri libere şi corecte în continuare, astfel încât la alegerile parlamentare anticipate din toamna acestui an procesul electoral să fie îmbunătăţit.