Participarea alegătorilor la scrutinul din 3 iunie este mai redusă decât în 2003
Până la ora 10.00, la alegerile locale generale au participat 7,77% din numărul total de alegători din R. Moldova, faţă de 9% la alegerile locale generale din 25 mai 2003.
Potrivit Comisiei Electorale Centrale, cea mai înaltă rată de prezenţă la urne s-a înregistrat în Rezina, de 27,37%. La polul opus, cu 2,68 % se situează mun. Chişinău. În Bălţi au votat 5,1% din alegători.
Într-un comunicat de presă al CEC se menţionează că votarea decurge fără încălcări grave, cu excepţia satului Corjova, r-nul Dubăsari, unde organele de forţă neconstituţionale ale regimului separatist din stânga Nistrului au ocupat secţia de votare nr.15/5 şi nu permit desfăşurarea votării. La locul incidentului se află observatorii internaţionali şi reprezentanţi ai Ministerului Reintegrării.
Au fost, de asemenea, semnalate unele probleme tehnice legate de buletinele de vot. Nereguli s-au depistat şi în raionul Cantemir, s. Chioselia, unde în dreptul unui candidat la funcţia de primar nu s-a aplicat ştampila retras, aşa cum stabilise Curtea de Apel.
Un raport al Coaliţiei 2007 atestă însă mai multe probleme ce ţin de procesul de alegeri, inclusiv tentativa unui membru al biroului electoral de a introduce în urna de vot mai multe buletine.